Таймер1 включен в Fast PWM, 10-bit.
Вроде как всё работает, но если в OCR1A (или OCR1B, тот же результат) забить значения,
когда младший байт (OCR1AL) равен нулю - на выходе короткие импульсы.
Т.е. три значения:
256->OCR1A
512->OCR1A
768->OCR1A
дают короткие импульсы на выходе (вдвое короче ,чем при 1->OCR1A).
Остальные числа дают адекватный результат.

Моделирую в Протеусе. Железка сгорела ( ) , заказал, жду.
Может это глюк Протеуса? Будет железо - проверю.
А пока... Чёт я не догоняю. Может кто сталкивался?

Это нормально.
В каждом описании на контроллер, имеющий таймер-счетчик, в режиме
( быстрый ШИМ ) эта ситуация упоминается.

Выписка из DATASHEET:

Fast PWM Mode.

" The extreme values for the OCRnA Register represents special cases when generating a PWM
waveform output in the fast PWM mode. If the OCRnA is set equal to BOTTOM, the output will
be a narrow spike for each MAX+1 timer clock cycle. Setting the OCRnA equal to MAX will resultin a constantly high or low output (depending on the polarity of the output set by the COMnA1:0
bits.) "

А насчет такого:

256->OCR1A
512->OCR1A
768->OCR1A

Это возможно неправильные настройки режима ШИМа, либо действительно глюки Протеуса.

Протеус, мать его.
Железо адекватно.